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“系统科学”是上海理工大学具有博士学位授予权的唯一一个理学学科，上海系统科学研究院建设单位。始建于1979年，是全国最早建立的同类学科之一，1993年获硕士学位授予权，1995年成为原机械工业部重点学科，2006年获博士学位授予权，2008年列入上海市教委重点学科建设计划，2012年列入上海市高校一流学科建设计划，2015获批上海市滨滨滨类高峰学科，2018年获批上海市高水平大学建设学科，同年由系统分析与集成二级博士点升为系统科学一级博士点，在2018年教育部第四轮学科评估结果中排名全国第叁，为我校排位最高学科。2019年10月，经国家人社部和全国博士后管委会批准，成立系统科学博士后流动站。

目前从事的主要研究方向：系统分析、优化、控制，系统生物学，复杂系统理论与方法，大数据与智能系统等。

流动站现有博士后合作导师20名。